На химфаке МГУ разработали цифрового помощника при поиске лекарств

Ученые химического факультета МГУ создали цифрового помощника — программу, которая контролирует качество данных при лабораторной расшифровке ДНК. Главная миссия этой программы — обеспечение надежности самых ответственных проектов (SELEX), отвечающих за поиск лекарственных аптамеров — специфических молекул, способных связываться с белками. Инновация не заменит ученого в лаборатории, а лишь усилит его работу, уверяют авторы.

Ценность инновации заключается в упрощении проведения так называемого нанопорового секвенирования клеток, в процессе которого происходит считывание нуклеотидного состава той или иной анализируемой молекулы. Метод основан на применении белковых или твердотельных пор диаметром всего лишь несколько нанометров, чувствительных к нуклеиновым кислотам. Отрицательно заряженная молекула ДНК при воздействии электрического поля проходит через такую нанопору, что приводит к изменению силы тока и позволяет определить, какой нуклеотид проходит в тот или иной момент.

Однако, чтобы верно идентифицировать исследуемые образцы, ученым приходится прикреплять к анализируемым молекулам искусственные метки, такие как адаптеры и баркоды. Если они прикреплены не в той последовательности или их мало, это сразу негативно отразится на результатах. Процесс присоединения меток — очень кропотливая и тонкая работа. Если они будут стоять неправильно, то на выходе вместо четкого научного результата получится хаотичный цифровой шум.